torsdag 1 maj 2014

Cystatin C on Cys- proteinaasiestäjä.

----ännu en svårighet med alla kreatininbaserade GFR-prediktionsekvationer, frånsett LM-ekvationen, är att de kräver speciella GFR-prediktionsekvationer för barn (t ex Schwartz, Counahan–Barratt) [30, 32-33].

Estimering med cystatin C.
Sedan 1979 är det känt att även plasma- och serumhalten av cystatin C är en markör för GFR [23, 34-37]. Cystatin C-halten varierar betydligt mindre än kreatininhalten med patientens muskelmassa, etniska bakgrund och ålder, och inte alls med tubulär sekretion, tubuluspåverkande läkemedel eller köttinnehållet i måltider. Därför kan cystatin C-baserade GFR-prediktionsekvationer av den enkla typen GFR = A × cystatin C-B, där A och B är konstanter, användas med lika god diagnostisk förmåga som betydligt mer komplicerade kreatininbaserade GFR-prediktionsekvationer som innehåller etnicitetstermer [23]. Dock måste man vara uppmärksam på att höga doser av kortikosteroider ökar syntesen av cystatin C så att cystatin C-halten i dessa fall inte korrekt återspeglar GFR [23, 38].
Fram till år 2010 [39] fanns ingen internationellt fastställd kalibrator för cystatin C, vilket försvårat användningen av och möjligheten att jämföra olika metoder att mäta cystatin C-halten.
För närvarande pågår ett standardiseringsarbete bland de bolag som tillverkar reagens för bestämning av cystatin C-halter som bl a innebär att alla ska basera sina bestämningsmetoder på den internationella cystatin C-kalibratorn ERM-DA471/IFCC. Arbetet har ännu inte resulterat i en minskad spridning mellan de metoder som är i bruk i Sverige, men förväntas göra det under 2013.---


http://www.uniprot.org/uniprot/P01034

        10         20         30         40         50         60 
MAGPLRAPLL LLAILAVALA VSPAAGSSPG KPPRLVGGPM DASVEEEGVR RALDFAVGEY 

        70         80         90        100        110        120 
NKASNDMYHS RALQVVRARK QIVAGVNYFL DVELGRTTCT KTQPNLDNCP FHDQPHLKRK 

       130        140 
AFCSFQIYAV PWQGTMTLSK STCQDA 


FunctionAs an inhibitor of cysteine proteinases, this protein is thought to serve an important physiological role as a local regulator of this enzyme activity.
Subunit structureHomodimer.
Subcellular locationSecreted Ref.19.
Tissue specificityExpressed in submandibular and sublingual saliva but not in parotid saliva (at protein level). Expressed in various body fluids, such as the cerebrospinal fluid and plasma. Expressed in highest levels in the epididymis, vas deferens, brain, thymus, and ovary and the lowest in the submandibular gland. Ref.16 Ref.19
Post-translational modificationThe Thr-25 variant is O-glycosylated with a core 1 or possibly core 8 glycan. The signal peptide of the O-glycosylated Thr-25 variant is cleaved between Ala-20 and Val-21.
Involvement in diseaseAmyloidosis 6 (AMYL6) [MIM:105150]: A hereditary generalized amyloidosis due to cystatin C amyloid deposition. Cystatin C amyloid accumulates in the walls of arteries, arterioles, and sometimes capillaries and veins of the brain, and in various organs including lymphoid tissue, spleen, salivary glands, and seminal vesicles. Amyloid deposition in the cerebral vessels results in cerebral amyloid angiopathy, cerebral hemorrhage and premature stroke. Cystatin C levels in the cerebrospinal fluid are abnormally low.
Note: The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. Ref.3 Ref.23
Macular degeneration, age-related, 11 (ARMD11) [MIM:611953]: A form of age-related macular degeneration, a multifactorial eye disease and the most common cause of irreversible vision loss in the developed world. In most patients, the disease is manifest as ophthalmoscopically visible yellowish accumulations of protein and lipid that lie beneath the retinal pigment epithelium and within an elastin-containing structure known as Bruch membrane.
Note: Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry. Ref.24
MiscellaneousPotential cerebrospinal fluid marker for the diagnosis of Creutzfeldt-Jakob disease.